学术查重和万方查重是两种常用的文献查重工具，虽然都可以用于检测文献的原创性，但它们在使用体验和功能上存在一些区别。学术查重主要针对学术领域，覆盖范围广，检测速度快，但需要购买会员才能使用；而万方查重则更注重于学位论文查重，提供了更加专业的查重报告和分析，但免费用户的功能相对受限。因此，选择使用哪种查重工具，可以根据自身需求和使用习惯来决定。

此外，学术查重和万方查重在查重算法上也有所不同。学术查重采用的是互联网查重算法，可以检测出文献在互联网上的相似度，对于学术抄袭有较好的检测效果；而万方查重则采用的是学术数据库查重算法，对于学术论文的查重更为准确。因此，在选择查重工具时，也要考虑到文献的类型和需要查重的具体要求。